1 сентября 1598 года, в праздник преподобного Симеона Столпника, произошло великое событие, ставшее исключительным явлением в истории Государства Российского. На Русское царство венчался первый избранный самодержец всея Руси – царь Борис Годунов.
Конечно, взойдя на трон, он не мог не отметить этот день особо, по русскому православному обычаю, которого придерживались великие князья на Руси. Взошел на престол – возведи храм. В числе "коронационных" мероприятий было его высокородное повеление построить несколько церквей в честь Симеона Столпника, как память о своем венчании на царство.
Церковь за Яузой была одним из таких деревянных храмов.